故事设定在商末周初，但与历史记载完全不同。少女蒲钊是墨家机关术的传人，在战乱中为了拯救被商朝太师抓走的族人，意外拔出了封印在“苍之曜”中的轩辕剑。剑中神灵告诉她，这个世界的天命被篡改了，本应灭亡的商朝因为有“黑火”机关术的加持，反而成了暴虐的统治方，而“起义”的周朝才是正义的一方。为了修正历史，蒲钊必须带着轩辕剑加入周军，对抗拥有强大“黑火”机关兽的商朝。在这个过程中，她发现她的青梅竹马被改造成了商朝最强的机关兵器“白虎”。一场关于天命、机关术与少年少女的悲壮史诗就此展开。