著名的钢琴演奏家冲野瑛斗在一场车祸后失去了近三年的记忆。他试图通过演奏来恢复记忆，却发现每当自己弹奏巴赫一首无人知晓的《D小调间奏曲》时，电视新闻里就会播报一起离奇的死亡事件，且死因与乐曲的情绪完美契合。惊恐之余，他在自己的乐谱夹中发现了一份名单，上面的人名与死者的姓名一一对应。为了弄清真相，瑛斗与前女友、刑警雪村莉绪开始联手调查。他们发现，这三年间，瑛斗竟秘密成为了一个利用“音乐频率共振”原理杀人的神秘组织的“演奏者”。然而，随着调查深入，雪村莉绪发现，真正的瑛斗可能早在三年前就已死亡，眼前这位“天才”不过是接受了记忆移植的替身，而真正的幕后黑手，正是指挥这场生死“间奏曲”的指挥家。